En el "Taller para Analizar la Viabilidad Poblacional del Lobo Mexicano" realizado en Fossil Rim Texas, se acentuó la urgencia de aumentar el número de fundadores, la población efectiva y disminuir la homocigosis de la población cautiva de lobos mexicanos (L-registrado) evaluando a todos los lobos que pudieran ser Canis lupus baileyi puros, mediante las pruebas genéticas disponibles (16), con objeto de usarlos en el programa de cría en cautiverio (13).  Se propuso examinar al linaje San Juan de Aragón (L-SJA) con carácter de alta prioridad (13) en vista de que estudios previos sugieren la posibilidad de que sean auténticos (20).

   Si el L-SJA resultara de C. l. baileyi puros y se incluyera en el programa de reproducción en cautiverio, aumentaría el número de fundadores y de población efectiva.  La consanguinidad y grado de parentesco se rompería (1); y si también se aceptara usar al L-ASDM-GR, la población cautiva sería genéticamente mas apta para la reliberación y las posibilidades de recuperación de la subespecie serían mayores.

   Para la certificación del L-SJA se deben aplicar las técnicas de enzimas de restricción con ADN mitocondrial y electroforesis en gel de almidón según Hillis y Davis (1983) (13).

   Para analizar la variación del ADN mitocondrial, las enzimas de restricción, cortan las moléculas de ADN en una secuencia específica de bases.  Al romperse así las moléculas de ADN se someten a un campo eléctrico migrando a diferentes velocidades y al ser teñidas aparece un patrón de bandas característico.  Al comparar los patrones de diferentes individuos o especies, las diferencias en los patrones de bandas reflejan variación genética entre tales individuos o especies.  Si se usan varias enzimas diferentes, se puede elaborar un cuadro de similitudes y diferencias (16).  En el lobo mexicano existe un genotipo de ADN mt único que no se encuentra en ningún otro lobo gris de Norteamérica ni en perros, coyotes o lobos rojos (13).  Este marcador es el locus PGI-2 (13).  Si se encuentra este marcador genético en los lobos del L-SJA, se puede asegurar que se trata de lobos mexicanos puros.